IE 9 버전이하로 접속하면 팝업창을 띄워  IE11로 업글레이드를 권장하고 싶습니다.

좀 다른 이야기인데, 지금 IE9 이하를 쓰시는 분들이라면 진짜 컴맹이거나 아니면 정부기관 같은것들 때문에 어쩔 수 없이 쓰시는 분들일겁니다. 전자든 후자든간에 업그레이드 안내 팝업창 띄워봤자 해결도 불가능하고 그냥 거슬리는거 하나 생긴 걸로밖에 안 보여질 겁니다. (차라리 크롬 설치 권장이 좀 더 현실성 있습니다. 물론 컴맹이라면 이것도 전혀 이해하지 못하고 그냥 사이트만 욕하고 안 들어오거나 하겠지요)

딱히 버전 업데이트 할 필요가 없어서 업데이트라는 것을 모르는 사람도 있고,
ActiveX 때문에 버전을 올리면 정부기관 같은 독특한(...) 사이트를 이용하지 못하는 경우도 있습니다.

화면을 가린다면 오히려 짜증나서 업데이트 하기가 더 싫어질 수도 있습니다.
굳이 최신 브라우저 업데이트를 권고해야 한다면 팝업창으로 구현하는 것보다는 사이트 디자인에 묻어가는 편이 나을 것 같네요.