라이믹스 files 폴더가 안보입니다.

정상입니다. files 폴더는 라이믹스를 설치하고 사용하면서 만들어지는 설정 파일, 첨부파일 등이 쌓이는 공간으로, 오직 님 사이트에만 존재하는 데이터이므로 설치 전에는 존재하지 않습니다. 퍼미션 문제가 없는 호스팅이라면 설치시 files 폴더가 자동으로 생깁니다. (만약 자동으로 생기지 않는다면 FTP에서 직접 만들고 퍼미션을 조정해 줘야 합니다.)

운영중인 홈페이지의 코어를 업데이트할 때 zip 파일을 다운받아서 통째로 덮어씌워도 괜찮은 이유이기도 하죠. 님 사이트의 중요한 설정 파일, 첨부파일 등이 저장된 files 폴더는 덮어씌우지 않으니까요.